El primer genoma mitocondrial completo de Diadema antillarum (Diadematoida, Diadematidae)

Audrey Majeske; Alejandro J. Mercado Capote; Aleksey Komissarov; Anna Bogdanova; Nikolaos V. Schizas; Stephanie O. Castro Márquez; Kenneth Hilkert; Walter Wolfsberger; Tarás K. Oleksyk

doi:10.1590/SciELOPreprints.5055

article.authors6a3476321d596

Audrey Majeske Recinto Universitario de Mayagüez y Universidad de Oakland https://orcid.org/0000-0002-2178-5869
Alejandro J. Mercado Capote Recinto Universitario de Mayagüez
Aleksey Komissarov ITMO University https://orcid.org/0000-0001-6981-7316
Anna Bogdanova ITMO University
Nikolaos V. Schizas Recinto Universitario de Mayagüez https://orcid.org/0000-0002-9199-6960
Stephanie O. Castro Márquez Oakland University https://orcid.org/0000-0002-9766-1299
Kenneth Hilkert Oakland University https://orcid.org/0000-0002-1530-0415
Walter Wolfsberger Oakland University y Universidad Nacional de Uzhhorod
Tarás K. Oleksyk Recinto Universitario de Mayagüez; Universidad de Oakland, and Universidad Nacional de Uzhhorod

DOI:

https://doi.org/10.1590/SciELOPreprints.5055

Keywords:

mitogenome, echinoderm, invertebrate, phylogeny, black sea urchin, long-spined sea urchin

Resumen

El genoma mitocondrial del erizo de mar negro de espinas largas, Diadema antillarum, se secuenció utilizando la tecnología de secuenciación de nueva generación de Illumina. El mitogenoma completo tiene un tamaño de 15,708 pb, que contiene dos ARNr, 22 ARNt y 13 genes codificadores de proteínas, además de una región de control no codificante de 133 pb. La composición de nucleótidos es 18.37% G, 23.79% C, 26.84% A y 30.99% T. El sesgo A+T es del 57.84%. El análisis filogenético basado en 12 genomas mitocondriales completos de erizos de mar, incluyendo cuatro especies de la familia Diadematidae, apoya la monofilia familiar. Sin embargo, las dos especies de Diadema en este estudio, D. antillarum y D. setosum no fueron identificadas como taxones hermanos.