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Preprint / Versión 1

Empleo de la RT-PCR en el diagnóstico del SARS-CoV-2

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José Francisco Cancino Mesa Universidad de Ciencias Médicas de Granma, Facultad de Ciencias Médicas de Manzanillo Celia Sánchez Manduley, Granma, Cuba https://orcid.org/0000-0002-9328-9856
Adrián Alejandro Vitón Castillo Universidad de Ciencias Médicas de Pinar del Río, Facultad de Ciencias Médicas Ernesto Guevara de la Serna, Pinar del Río, Cuba https://orcid.org/0000-0002-7811-2470

DOI:

https://doi.org/10.1590/SciELOPreprints.707

Keywords:

Infecciones por Coronavirus, Reacción en Cadena de la Polimerasa, Técnicas de Laboratorio Clínico

Resumen

Introducción: la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa es una técnica precisa en la detección de coronavirus. Por su seguridad demostrada en el diagnóstico de cepas MERS-CoV y SARS-CoV, se seleccionó como prueba confirmatoria de infección por SARS-CoV-2.

Objetivo: caracterizar la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa como principal prueba diagnóstica en la detección del SARS-CoV-2 durante el período activo de replicación viral.

Método: se realizó una revisión de la literatura en artículos publicados hasta mayo de 2020. Se consultaron las bases de datos: Scopus, Wiley Online Library, SciELO, DIALNET, EBSCO, MEDLINE y PubMed. Se recuperaron artículos en español e inglés, seleccionándose 46 referencias.

Desarrollo: la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR) para detectar SARS-CoV-2 consiste en la lectura de la ARN polimerasa dependiente del ARN (RdRp), fragmentos ORF1ab, el gen E, el gen N y el gen S. El exudado nasofaríngeo ofrece mejores resultados que el orofaríngeo y saliva como muestra. Resulta necesaria la inclusión de pruebas RT-PCR que utilicen especímenes de hisopado rectal en casos sospechosos falsos negativos. El ensayo Reverse Transcription Loop-mediated Isothermal Assay demostró mayor rapidez diagnóstica que la RT-PCR con igual sensibilidad y especificidad.

Conclusiones: la disponibilidad de pruebas diagnósticas es crucial para el aislamiento de casos positivos y el seguimiento de la cadena epidemiológica de transmisión. La RT-PCR resultó ser la prueba de elección durante el período de replicación viral. El ensayo RT-LAMP es una alternativa diagnóstica rápida con principios similares a la RT-PCR.